Variables
Descripción
¿Qué calcula esta fórmula?
La energía libre de unión cuantifica la favorabilidad termodinámica de la interacción entre un ligando y su molécula objetivo.
Valores más negativos de energía libre corresponden a afinidades de unión más fuertes y a constantes de disociación más pequeñas.
Esta relación conecta la termodinámica molecular con las constantes de equilibrio medidas experimentalmente.
Cuándo se utiliza
Se utiliza para estudiar interacciones proteína-ligando, unión a receptores, docking molecular, química medicinal, biofísica y análisis termodinámicos.
Ejemplo
Un ligando posee:
Kd = 1×10⁻⁹ mol/L
T = 298 K
R = 8.314 J·mol⁻¹·K⁻¹
Fórmula:
ΔG = RT ln(Kd)
Sustitución:
ΔG = 8.314 × 298 × ln(1×10⁻⁹)
ΔG = -51.4 kJ/mol
Resultado:
Energía libre de unión ≈ -51.4 kJ/mol
El valor negativo indica una unión espontánea y favorable.
Aplicaciones
- Interacciones proteína-ligando
- Descubrimiento de fármacos
- Docking molecular
- Biología estructural
- Biofísica
- Química medicinal
- Análisis termodinámico
Nota
Esta ecuación supone condiciones de equilibrio y termodinámica de estado estándar. En muchos textos bioquímicos la relación puede escribirse como:
ΔG° = RT ln(Kd)
o de forma equivalente:
ΔG° = -RT ln(Ka)
donde Ka es la constante de asociación. Ambas expresiones describen la misma relación termodinámica utilizando constantes de equilibrio recíprocas.